โปรตอนนิวเคลียร์แมกเนติกเรโซแนนซ์เป็นวิธีวิเคราะห์ที่อาศัยคุณสมบัติทางแม่เหล็กของโปรตอน เมื่อโปรตอนอยู่ในสนามแม่เหล็กไฟฟ้าจะสามารถดูดกลืนพลังงานแม่เหล็กไฟฟ้าในช่วงความถี่คลื่นวิทยุที่เหมาะสมแล้วเกิดการเรโซแนนซ์ได้ เนื่องจากโปรตอนแต่ละตัวในโมเลกุลอยู่ในสิ่งแวดล้อมทางโมเลกุลที่ไม่เหมือนกัน ได้รับอิทธิพลจากความเข้มของสนามแม่เหล็กไม่เท่ากัน จึงเกิดการเรโซแนนซ์และปรากฏบนสเปกตรัมในตำแหน่งที่แตกต่างกัน ทำให้การวิเคราะห์ด้วยโปรตอนนิวเคลียร์แมกเนติกเรโซแนนซ์มีความจำเพาะเจาะจงสูง สามารถใช้ในการอธิบายโครงสร้างทางเคมีและพิสูจน์เอกลักษณ์ของอินทรียสารได้ ในตำรายาทั้ง British Pharmacopoeia, European Pharmacopoeia และ United States Pharmacopeia จึงมีการนำโปรตอนนิวเคลียร์แมกเนติกเรโซแนนซ์มาประกอบเป็นข้อกำหนดในการพิสูจน์เอกลักษณ์ยา โดยเฉพาะยาที่มีโครงสร้างซับซ้อน เช่น เปปไทด์ เป็นต้น

โปรตอนนิวเคลียร์แมกเนติกเรโซแนนซ์สเปกโทรสโกปี, การพิสูจน์เอกลักษณ์, การวิเคราะห์เชิงคุณภาพ, ตำรายา